Das Schulleben der Johanna-Gerdes-Grundschule basiert im Rahmen der gesetzlichen Vorgaben auf dem Prinzip einer möglichst weitgehenden Selbstverwaltung. Diese wird durch verschiedene Gremien (Vorstand des Vereins, Lehrerkonferenz, Gesamtelternvertreterversammlung, Mitgliederversammlung, Elternabende u.a.) ermöglicht. Der gemeinnützige Schulträgerverein wird durch einen fünfköpfigen Vorstand vertreten, der von der Mitgliederversammlung gewählt wird. Die Schulleitung ist Mitglied durch ihr Amt.
Alle Elternsprecher kommen ca. dreimal im Jahr zu der Gesamtelternversammlung zusammen. Die Elternvertreter der jeweiligen Klassen wählen in der ersten Sitzung im Schuljahr zwei GEV-Vorsitzende.
Die GEV bietet Raum für einen ausführlichen Informationsaustausch zwischen Eltern und Schulleitung. Hier werden Probleme im Schulalltag diskutiert, Lösungsstrategien gesucht, Anregungen für die Gestaltung des Schullebens eingebracht und die aktuellen Anliegen der Elternschaft der einzelnen Klassen besprochen. Die Elternvertreterinnen und Elternvertreter sind auf diese Weise einerseits Sprachrohr aus der Klasse in die GEV, andererseits aber auch Vermittler der Anliegen der Schulleitung in die Klassen hinein, insbesondere bei der Organisation von Festen oder Tagen der Offenen Tür. Die Elternvertreter verschicken die Protokolle der GEV-Sitzungen an die Elterngemeinschaft ihrer Klasse.
Die Verzahnung aller Gremien an der Johanna-Gerdes-Grundschule ist die Schulkonferenz. Hier kommen die Schulleitung, Vertreter der Mitarbeiter, die Gesamtelternvertreter, Vertreter des Fördervereins sowie Vorstand und Beiräte des Vereins der Johanna-Gerdes-Grundschule (in dem alle Eltern und Lehrkräfte Mitglied sind) zusammen. In der Schulkonferenz werden mit Ausnahme von Personalangelegenheiten und Schulfinanzen alle wichtigen Angelegenheiten der Schule beraten. Wenn es um originäre Belange der Schülerschaft geht, sind auch Vertreter der Schülerschaft der Klassen 5 und 6 geladen. Der Vorsitzende des Vorstands des Vereins der Johanna-Gerdes-Grundschule führt durch die Sitzung, die mindestens einmal im Schuljahr einberufen wird. Ein Protokoll wird anschließend schulintern verteilt.